万方硕士查重是指通过万方数据库进行文献查重，主要用于检测学术论文的原创性和重复率。与知网查重相比，万方硕士查重的数据库资源更为广泛，包含了更多的学术文献资源，能够提供更全面的查重服务。此外，万方硕士查重在查重速度和准确性上也有一定优势，能够更快速地完成查重任务，并准确判断文献的重复率。

而知网查重则是指通过知网数据库进行文献查重，同样用于检测学术论文的原创性和重复率。相较于万方硕士查重，知网查重在一些领域的覆盖率和准确性上可能略有不足，但也是广泛应用的查重工具之一。在选择使用哪种查重工具时，可以根据具体需求和研究领域来进行权衡和选择。